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此标识在视觉感受上的第一表现特征，可抽象地表达为南京大学英文缩写“NJU”。
其次，此标识在整体上表现为一面迎风飘扬的旗帜，象征着南京大学高举着追求真理、勇于拓新的旗帜，奋勇前行。
再者，此标识如同一支在熊熊燃烧的火炬，象征着南京大学一个世纪以来的优良传统如薪火相继、代代相传。
第四，此标识的三笔在位置上表现得富有层次感，体现出南京大学奋发向上的精神面貌，同时也象征着南京大学不断地向更高的台阶迈进。
历史内涵：
此标识浓缩了南京大学的百年沧桑，是对南京大学在一个世纪内风雨历程的凝练。
第一笔象征着南京大学在解放前的历史。从三江师范学堂到国立中央大学的近半个世纪，我校的影响与地位与日俱增。在迭经变革中，三江师范学堂和两江优级师范学堂堪称“中国师范学堂之嚆矢”；南京高等师范学堂与北大合称“南高北大”；国立东南大学享誉江南；国立中央大学在1928年建立后遂成中国高校之首。形象化的“1”，不仅是寓意我校在前半个世纪位居中国第一，也是寓意我校在中国高校历史中写下了浓墨重彩的一笔。
第二笔象征着南京大学自解放后到改革开放前的历史。在这个时期中，我校受到了院系大调整和文化大革命的冲击，在实力上有所削弱，但是在总的态势上我们仍然在稳步发展。在当时艰苦的条件下，我校师生取得了令人侧目的成绩。颇有气势的一捺，寓意我校虽然经历了挫折，但是仍在向上发展、百折不挠。
第三笔象征着改革开放后的历史。我校在八十年代稍有小挫而蓄势待发，自八十年代末高歌猛进、重新崛起，迅速跻身于中国一流大学之列，并向成为具有国际性影响的综合大学的目标前进。有力的一钩，寓意着我校在积淀后走向复兴。
传统内涵：
此标识体现出了南京大学百年的优良传统，并且通过一代一代的南大人发扬光大。
第一笔厚重踏实且气势非凡，展现出了南京大学一个世纪以来的“诚、朴、雄、伟”。南京大学的发展离不开前辈先贤的鼎力开拓，他们用份量丰实的成果、朴实求真的学风为后人奠定了坚实的基础。
第二笔和第三笔飘逸洒脱且寓意奋发，是对南京大学踏着前人的步伐锐意进取、革故鼎新的表现。南京大学并不局囿于对传统的遵从，同时在每一个时期都注重对传统的阐发创新，使南大精神如薪火相传、继承彰显。
现代内涵：
此标识具有鲜明的现代气息和时代特色，表现出了南京大学跟随时代的脉搏，在时代洪流中挺立潮头的形象。
第一笔实在稳重，象征着南京大学把握住了时代的节奏，以庄重的态度迎接时代的挑战。第一笔的下半部分象火箭喷射出的火焰，象征着南京大学在蓬勃发展。
第二笔和第三笔格调昂扬，体现出了南京大学积极进取、斗志昂扬的时代弄潮儿的富有现代性的形象。同时，第三笔在位置上高于第二笔，也象征了我校的发展节节拔高、日新月异。
知识内涵：
此标识形象的表达出了南京大学一百年来对知识这一社会发展推动力的态度，同时表达出了南京大学人才培养方针的意含。
第一笔象征着南京大学注重知识的积累沉淀，拥有深厚的知识底蕴。第一笔的下半部分以虚就实，喻指南京大学的的深不见底的知识涵养正是学术科研力量强大的表现。
同时，第一笔也象征着南京大学的本科教育注重基础知识的学习培养，以使广大学子在更高阶段的学习中游刃有余。
第二笔和第三笔体现了南京大学对“知识就是力量”的认可，并且鼓励对知识的钩沉与探索，如老树新花更着妍丽。最后一笔的上扬象征着对无限广阔的知识空间的探索追求。
同时，第二笔和第三笔也象征着南京大学对硕士和博士阶段的培养态度，即激励他们对知识的创新发展。最后一笔的顶端是南京大学高精尖人才的象征，体现出了我校的学术科研水平。
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